由于現今水源污染越發嚴重，水質的富營養化、藻類的爆發、藻毒素的污染等等，都在危害著環境和人類的健康。在積極加強創建環境友好型社會的同時，藻類監測事業以逐漸在國內開展起來。另外，藻類水華與赤潮頻發，關于有毒藻類的報道屢見不鮮，特別是部分地區藻類的爆發對城鎮居民的生活用水造成污染。國家環保部、水利部等部門先后召開工作會議，要求各地監測單位組織力量積極開展藻類監測。而藻類分類計數儀取代人工鏡檢計數，提高工作效率和準確性。
 

　　藻類分類計數儀主要應用于環保，衛生防疫，自來水，化工等單位，用于飲用水在線監測及河流、湖泊、海洋藻類以及浮游生物的測量監測和研究。性能參數編輯、打?。禾峁┚帉懩０?、文本輸入、打印預覽、數據導出：藻類統計數據導出到EXCEL。
 

　　目前，使用藻類分類計數儀進行藻類監測主要有在線監測和人工鏡檢兩種方法。
 

　　在線監測：藍藻、綠藻、硅藻等常見藻類含有葉綠素a，在一定波長的激發光作用下產生熒光，通過熒光檢測儀器收集熒光信號，計算熒光值，利用熒光信號與葉綠素a濃度之間的比例關系，根據熒光反應特性的不同，區分各種藻類并間接測定水體中葉綠素a濃度、藻密度等參數。此種方法采用原位監測，快速簡便，但測定數據受溫度、光照強度、鹽度、水體深度等多種環境因素影響;對藻類監測只能達到門，不能具體到屬種，無法找出優勢種，監測結果存在較大偏差。
 

　　人工鏡檢：采集水樣，然后預處理，將水樣滴加到細胞計數框上，制片，在顯微鏡下對100個視野中的藻類進行分類計數，判定優勢種，計算藻密度。人工鏡檢方法可以對藻類進行直接觀察計數并鑒定到屬種，但不能進行原位檢測，用時較長，容易產生視覺疲勞，人為判定也存在一些誤差，同時需要操作者具有一定的藻類分類學知識和經驗。而我國藻類監測起步較晚，基礎薄弱，國內只有少數研究機構從事藻類監測工作，研究人員水平參差不齊，藻類監測領域人才嚴重短缺。